Nature:风险!微生物组可能泄露私隐

2022-02-14 11:18:53 来源:
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来源于生命老鼠的细菌DNA可作为“消化道纹”(gut print)来标识应有在此之后。通过寄宿某药剂内的生物DNA可标识出有此人的在此之后。科学研究执法人员发现,通过寄宿药剂的生物集成DNA,尽可能特异适度地标识出有应有的在此之后,这就造成了了恶意难题。这项发现刊发于5月11日的《美国国家政府瑞典皇家科学院Journal》(Proceedings of the National Academy of Sciences)上。评论表明有,在一项匿名试验车科学研究里面,通过幼虫于药剂的生物(即其生物四组),很有可能会标识出有应有在此之后,从而篡改某人的健康、肉类以及种族等具体统计数据。无独有偶,4月29日发表于《基因四组科学研究》(Genome Research)的一项科学研究也据称,在由NIH维护的可见一斑生物四组DNA统计数据里面,也带有具备潜在辨识适度的生命DNA。当然,两篇科学论文均未依据生物四组的统计数据援引出有测试者的住址——估计现在所这么好好也就会很难于——但他们有提出批评有,这种具备引导适度的生物四组科学研究某种程度获取核准。来自马萨诸塞州波斯顿哈佛陈曾熙公共卫生学院(Harvard T. H. Chan School of Public Health)的算出动物学家Curtis Huttenhower牵头了这项最新出有炉的科学研究。他问到,现在所,生物四组的统计数据管理还抱着点儿南部荒原的意思。但随着整个行业的发展,人们须要理应地确信,他们的生物四组具备高度的特异适度。说是这有事并不牛奶,生命基因四组科学研究早就因为该软件难题受到了数年的关切。2013年,有学者宣布,他们能在一项国际适度的***基因四组重大项目(1,000 Genomes project)里面,确定出有5位匿名测试者的住址,这是通过参见其DNA以及宗族谱系索引(之外年长、居住地和姓氏)获知的。近年来,生物四组对生命的健康与行为的影响已逐渐成为科学研究的热点。而生命生物四组科学研究中心得的统计数据一般而言都以公开贮存库作为最后的归宿,但随着时间的推移,这些生物四组应该尽可能永久适度地标识出有隶属特定的人,现在所尚未正确。Huttenhower的制作组利用来源于NIH生命生物四组开发计划(HMP)的公开统计数据,搜索独有药剂各个部位的检验(之外消化道、口腔、皮肤上和),以将这些同时具备特定标识适度和时间稳定适度的生物基因型标记四组合一起(尽管HMP难以标识出有应有住址,但分辨出有检验的捐出依此(数周前所或数月前所)还是可能会的。)。值得一提的是,老鼠检验能提供者最佳的生物标识标志:在86%的只能,一应有的首次检验能与其二次检验都是。而皮肤上检验能获得正确给定的概率只有大约四分之一。学者还表明有,在标识应有方面,基于个体生物抗生素的DNA标记能起到最佳作用,它比那些基于生物种类的标识方法要好得多。对于制作组的成果,Huttenhower总结道,这某种程度就是“利用生物四组统计数据,通过实质上试验车,方可非凡适度地挑战所有难题”。他确信,可能会时有发生的该软件不确定性漏洞恐怕在于科学研究方案上,比如某人加入了两项相异的生物四组科学研究,若每一四组都带有相异的补充统计数据(诸如年长及健康),那就可能会出有现篡改。不过,生物四组本身就可能会造成了该软件不确定性,因为它们不可避免地与生命DNA爱恋接踵而来。尽管NIH早已竭力思考如何去除生命DNA的方法,以防其进到HMP索引,但结果不明朗。据密苏里州劳伦斯利弗莫尔国家政府科学研究小组(Lawrence Livermore National Laboratory)的一位算出动物学家、制作组带头人Jonathan Allen发现,检验的污染难题仍值得注意。该制作组探究到,细串联重复基因序列(short tandem repeats)一般在相异的人里面就会保持一致,因此在法医学里面用于DNA给定。但这种基因序列若是出有现在生物四组检验里面,应该能构成一个正确的DNA标记呢?Allen问到现在所还难以确定,但它在对政府适用适度DNA索引的出有现率的提高提高了这种可能会适度。《基因四组科学研究》问到,只要NIH能从其索引里面施用已知的生命基因基因序列,那么他们就提议刊发Allen及其制作组的科学论文。纽约基因四组里面心(New York Genome Center)的算出植物学家Yaniv Erlich所一同的制作组正是在***基因四组科学研究里面标识出有了测试者。他问到,虽然非常少基于生物四组来标识出有某人的概率很低,但学者们应该回避适当的措施来保护恶意。而密苏里州洛佩兹贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的动物学家Amy McGuire问到,由于加入HMP的测试者都已被告知不确定性存在,所以他确信,不某种程度就会出有现针对此有事的非理适度灾难。但是,自由基过度却可能会就会消除人们对生物四组的探究步伐。坐落马里兰州贝塞斯达的NIH附属国立生命基因四组科学研究中心(National Human Genome Research Institute)的政策负责人Laura Rodriguez问到,只要保护措施同步进行,比如尽可能会地将生命DNA从HMP索引里面去除,那么“我们将努力保持其大门开放,毕竟它能为科学增添重要性。”原始出有处:Ewen Callaway.Microbiomes raise privacy concerns.Nature, May 11, 2015.doi:10.1038/521136a
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