Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中的细菌表观遗传标记的存在

2022-01-03 00:47:46 来源:
分享:

导言:在最初阶段,自然界就开始了在不变动酵母菌线粒体DNA其组织左至右的前提下来使其DNA发挥不同的功能,而这就是通过给DNA亚基上去掉化学记号来充分利用的。DNA甲基化是爬行动物的极其重要表征表型机制,其当中5-甲基嘧啶(5mc)是最常见的DNA剪裁之一。6mdA是酵母菌限制性剪裁系统对的大体上组成成分,现阶段在爬行动物当中考量到已知的限制性剪裁系统对。原本有不少研究者报道,6mdA也假定于爬行动物当中,但并而所支持。

已对,在《科学成效》上的一项研究者当中,瑞典林雪平大学的研究者其他部门得出结论,爬行动物线粒体当中假定酵母菌表征表型记号很可能被污染了,并且没有必要的证据来断言爬行动物当中假定这种剪裁。

N6-甲基甘氨酸(6mdA)是酵母菌当中普遍的DNA剪裁,但最近在爬行动物DNA当中也得到了表征。然而,研究者其他部门提到,即使对来自相同爬行动物线粒体类型的DNA进行的6mdA谱图和丰度计算研究者也不一致。

为了有利于说明6mdA在爬行动物谱系规格当中的作用,研究者其他部门利用了体外将有机体幼稚T辅助(NTH)线粒体变异为TH线粒体亚群的能力。但是,与原本的研究者相反,他们推断出TH变异过程当中6mdA的丰度没有全局变化,并且观察到变异的T线粒体当中的6mdA技术水平与未甲基化的全原核生物扩增DNA相同,这得出结论6mdA并未以可检验的技术水平假定有机体T线粒体当中。

他们还统计分析了从六个有机体线粒体系当中提取的DNA当中的6mdA,并鉴定出两个具有高于背景噪声技术水平的6mdA技术水平的线粒体系。出乎意料的是,两种单独的293T线粒体系培训物具有不同的6mdA技术水平,这得出结论研究者其他部门观察到的6mdA信号并非线粒体类型本身固有的。或许,当他们有利于看时,他们推断出两条6mdA技术水平升高的线粒体系被支原体属污染,支原体属一种常见的酵母菌线粒体培训物当中非常丰富6mdA的污染物。当他们用支原体甲基化类固醇Plasmocin处理线粒体系时,6mdA信号减低为A有性对照。

“我们或许通过这些新技术检验到的6mdA'信号'只是噪声。但是,由于一些复杂的新技术问题,几种原理当中的背景噪声不是随机的,而是真实信号。”高级创作者Colm Nestor(维斯姆·内斯特)在一份声明当中却说。

研究者其他部门统计分析了以前通过DNA免疫沉淀基因组、质谱和单水分子实时基因组在爬行动物线粒体当中定位或检验6mdA的努力。人们推断出每种原理都有普遍性或原因,使表征表型记号的假阳性推断出率很高,或许得出结论林雪平研究者其他部门认为不假定这种周期性的证据。

这组创作者提到:“我们断言,RNA和酵母菌污染、病原体交叠反应性和其他新技术限制的紧密结合已导致6mdA在爬行动物DNA当中的有规律错误辨别。随着DNA和RNA剪裁表亲的慢慢放缓,以及以前未知剪裁的具体表现越来越鲜见,即使常用多种互补原理,我们也强调了错误推断出的可能性。我们建议常用剪裁和未剪裁的原核生物DNA标准作为今后对比较丰富DNA剪裁的研究者的最低要求,以及在常用前更全面地验证病原体甲基化。”

内斯特补充却说,研究者其他部门在研究者极其鲜见的周期性时必须极其轻轻,选择常用哪种原理,并考量他们是否真正在衡量假定的感官。他却说:“现在我们可以毫无疑问地却说爬行动物当中不假定6mdA。关于6mdA,如果研究者其他部门取消研究者实际上不假定的进去,则可以节省大量时间和金钱,并且避免了很多最让人沮丧的事情。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

分享:
365整形网 整形医院哪家好 五官整容整形 整形医院咨询 整形知识 整形医生 美容整形 整形医院排名 整形医院咨询 整形专业知识 济南整形医院 C店求购 快手买卖平台 抖音号出售 出售公众号网站 买卖小红书网站 出售快手网 出售小红书网站