今年肆虐亚洲地区的新HG流感病毒所引发的重大疫情不仅将学术深入研究冲破了开发抗病毒和治疗性免疫球酶的中间地带，也在公众中的日后次圣万了“抗病毒”“免疫球酶检测”“中的和性免疫球酶”等专业名词及其便是蕴含的坚实免疫学知识。作为体液免疫的关键性酶波动分子之一，免疫球酶在人体标识和减轻微生若无、病毒等病原菌侵染更为实质性中的起着关键性抑制作用。
免疫球酶作为分泌HG的免疫球酶（Immunoglobulin， Ig），经B淋巴肝细胞转化，是由两组一对一的重链（IgH）和轻链（IgL）经天冬氨酸相连组成的YHG酶复合体。IgH和IgL分别带有可视区底下和恒定区底下，其中的可视区底下特异性标识和混合免疫。可视区底下的UTF-性状由V(D)J上方体（V(D)J recombination）中间体产生。以IgH核苷酸为例，在人和激素性状组中的IgH核苷酸穿越数百万碱基对（megabase， Mb），由数百个V、十多个D、多个J性状线圈以及数以百计转录序列组成。在前体B淋巴肝细胞（progenitor B cell， 简称pro-B）受精更为实质性中的，V(D)J上方体中间体通过RAG内切酶催化折断一个D性状和一个J 性状线圈进而通过非同源改组尾故又称相连（NHEJ）路径相连折断线圈从而转变成DJH上方产若无，接着日后经过RAG 和NHEJ催化折断和相连一个VH性状到DJH上方产若无上，最终转变成一段基本的IgH可视区底下UTF-性状VHDJH。V(D)J上方体中间体转化大量可视区底下UTF-性状库是组成免疫球酶自然环境的关键性分子坚实之一。
V(D)J上方体中间体中的生产量数以百计的V、D、J性状线圈如何被RAG内切酶标识和大块从而策划转化十分多样化的可视区底下UTF-性状库是一个起因于且引人入胜的当前疑虑。尽管很多学术研究从（基因暗示）遗传学角度洞察了因素V(D)J上方体的多种因素，但是这一上方体更为实质性说明是如何引发的并不吻合。
相较人们一直推论的基于随机诱发的上方体更为实质性，近年来斯图尔特·史密斯医学学术研究员(HHMI)、哈佛法学院（HMS）和费城综合医院（BCH）的Frederick W. Alt副院长Laboratory通过一系列社才会活动暗示V(D)J上方体中间体很也许是通过RAG核仁追踪（RAG chromatin scanning）的离散化建模继续执行的。该Laboratory中期开创性地找到RAG带有离散化“”（tracking）和大块性状组带有特定一段距离的off-target序列的活性，并且该活性范围内与才会聚HG（convergent）CTCF混合线圈（CTCF-binding element， CBE）转变成的性状组内层状内部结构邻接（loop domain）吻合。紧接着，该Laboratory通过学术研究一类坐落于激素IgH核苷酸D肌腱VH性状下游紧邻的CBE的功能时实质性提出异议了显然基于核仁内层做成（loop extrusion）控制系统的RAG核仁追踪的离散化建模，该建模能够极好的解读肌腱VH-to-DJH的上方体更为实质性以及该更为实质性中的CBE的关键性抑制作用。该Laboratory随后发表的另一篇短文通过一系列试验中暗示该建模也极好解读了生理上的删除性D-to-JH上方体疑虑，并实质性暗示核仁内层做成在该上方体更为实质性中的持久关键性抑制作用。然而，有关RAG核仁追踪的社才会活动控制系统以及更为关键性的数以百计分隔于Mb大多的终故又称V性状是如何上方体的等疑虑仍然不吻合。
2020年7月初27日，来自斯图尔特·史密斯医学学术研究员(HHMI)、哈佛法学院（HMS）和费城综合医院（BCH）的Frederick W. Alt副院长以及国立身体健康学术研究员（NIH）的Rafael Casellas教授开发团队在Nature杂志以Accelerated Article PreviewHG式在线发表了题为“CTCF orchestrates long-range cohesin-driven V(D)J recombinational scanning”的学术研究短文（巴钊庆Clark为本文第一作者兼都由点对点作者，娄江曼Clark为都由一作）。该短文洞察了粘黏酶cohesin触发的核仁内层做成马达IgH核苷酸离散迁移从而透过RAG追踪的残基，并且洞察了CTCF在该控制系统持续上升控终故又称VH上方体中的的关键性抑制作用，由此为该领邻接起因于的一个当前疑虑透过了新的见解。
为了学术研究RAG核仁追踪的马达力疑虑，学术深入研究推论cohesin显然是一个关键性q。为了确实此论者，学术研究技术人员选用了激素永生化的v-Abl pro-B肝细胞系。该肝细胞系经诱导后能长期稳定穴居于有丝分裂的G1期，能大量触发RAG触发的D-to-JH上方体、少量触发肌腱而依然很难触发终故又称的VH-to-DJH上方体。先前在该肝细胞系的学术研究断定了其引发的D-to-JH和肌腱VH-to-DJH正是通过RAG追踪触发的，那么在该肝细胞系中的都为cohesin才会怎样呢？学术深入研究采用生长素诱导酶裂解元（auxin-inducible degron， AID）意图在该肝细胞系底下协作了cohesin复合若无关键性qRad21的AID裂解框架（Rad21-degron），通过填充auxin加速裂解Rad21。紧接着，学术深入研究通过ChIP-seq断定了全性状组大多IgH核苷酸cohesin的混合依然全部消失，而IgH 核苷酸磷酸化活性以及已知的核仁互作及V(D)J上方体要能性状的磷酸化或暗示皆没有祚着变化。学术深入研究进而通过巴钊庆Clark先前开发的3C-HTGTS找到除此大多的IgH核苷酸上依然所有的核仁内层状内部结构邻接都消失了，这与先前在其它类HG肝细胞中的的找到相反，即cohesin对于核仁内层做成转变成内层状内部结构邻接是要能的。十分有意思的是，学术深入研究实质性通过数据分析Rad21裂解前后D-to-JH和肌腱VH-to-DJH的变化找到，Rad21裂解依然减轻了所有肌腱VH-to-DJH上方体，剧烈减低了依然所有的D-to-JH上方体，除了坐落于RAG总体富含的V(D)J上方体中的心（recombination center， RC）内部的DQ52线圈的上方体。先前的学术研究暗示，DQ52由于其正处于RC的一段距离特殊性，可以通过诱发相比之下RAG而引发上方体，因此其上方体并不完全忽视cohesin触发的内层做成更为实质性。
为了更为好地探求cohesin遗漏的波动，学术研究在Rad21-degron控制系统底下通过CRISPR/Cas9实质性一声除了IGCR1线圈，先前找到IGCR1遗漏后RAG追踪提高至IgH肌腱VH区底下邻接从而导致肌腱VH都有是VH81X性状的上方体大幅下降时，那么在此为坚实遗漏了cohesin才会怎样呢？学术深入研究找到Rad21裂解依然依然减轻了所有提高了的肌腱VH-to-DJH上方体，同时也剧烈减低了依然所有的D-to-JH上方体，日后一次，只有DQ52上方体仍然能够引发。相对应的，Rad21裂解同时减轻了IgH核苷酸所有的核仁内层状内部结构，大多由于IGCR1遗漏而导致的前所未有有提高了的RC与肌腱VH错综复杂的内层状相互抑制作用。这些结果都由暗示cohesin极也许通过其触发的核仁内层做成触发了RAG追踪所继续执行的D-to-JH和肌腱VH-to-DJH上方体更为实质性。
除了肌腱VH性状，数百个终故又称VH性状是如何相比之下RAG而引发远距离上方体呢？一直以来人们推论终故又称VH显然通过一种IgH固有的“核苷酸减税”（physical locus contraction）更为实质性进行上方体。在该建模中的，终故又称VH核苷酸以某种未有知控制系统相比之下并内层绕RAG富含的上方体中的心从而使得每个VH性状以随机诱发的方式将相比之下RAG而上方体。由于缺失明确的控制系统支撑，该建模一直正处于猜想阶段。本文学术深入研究推论相较该随机诱发建模，与D和肌腱VH性状上方体值得注意，终故又称VH性状显然也是通过离散RAG核仁追踪更为实质性方才相比之下RAG而进行上方体。那么如何确实这一点呢？学术深入研究回避了一个机智的意图。
学术深入研究首先进行了平庸猜想：在VH区底下邻接，除了数百个VH性状除此以外还发挥作用着生产量数以百计的CTCF混合线圈CBEs；肌腱VH周边地区CBE在RAG追踪更为实质性中的除了能够提高与其周边地区的VH对于RAG的accessibility从而提高其上方体能够，还额除此以外阻截了RAG实质性追踪其干流的其它肌腱VH进而减弱了其上方体潜力；虽然数以百计终故又称VH性状错综复杂的CBE的说明功能尚未有可知，但这些CBE是否与肌腱CBE值得注意能够逐步阻截RAG干流追踪更为实质性，从而因素整个终故又称VH的上方体创造性？实质性混合他们的找到，其暗示与激素长时间前体B肝细胞相比，其衍生出来的v-Abl肝细胞系不用进行少量的肌腱VH上方体，而很难进行终故又称VH上方体；除此大多的，该肝细胞系中的IgH上方体中的心丢失了与终故又称VH核苷酸的内层状内部结构互作，而只发挥作用少量与肌腱VH核苷酸的互作。其主因一直未有知，如果这是由于数以百计CBE对内层做成触发的RAG离散追踪的阻截波动所导致的，那么抑制或添加所有这些CBE，是不是就能更为实质性触发终故又称VH的上方体？
为了验证这一点，学术深入研究在v-Abl肝细胞系协作了CTCF-degron裂解框架。填充auxin在主体素质上加速裂解CTCF后，ChIP-seq断定CTCF 裂解减轻或前所未有有持续上升了CTCF本身以及cohesin在性状组大多IgH上极少CBE核苷酸的混合；有意思的是，仍有一些CBE核苷酸被未有能完全裂解而“湿气的”CTCF酶混合，偏爱是那些正处于终故又称VH区底下邻接带有总体磷酸化活性的核苷酸。被诱导裂解后CTCF在核仁素质上的非皆一的混合变化显然洞察了完全相同CBE核苷酸自身的CTCF混合活性、局部核仁内层境或其它未有知因素。实质性的GRO-seq断定CTCF裂解从未有祚着因素IgH上方体中的心和VH偏爱终故又称VH磷酸化，也未有因素任何已知显然策划核仁相互抑制作用和V(D)J上方体的q的磷酸化，暗示CTCF裂解后的肝细胞仍然带有VH偏爱终故又称VH上方体的创造性。紧接着，学术深入研究通过3C-HTGTS找到，十分有意思的是，CTCF裂解反感完全恢复了v-Abl肝细胞系所丢失的RAG所在上方体中的心和依然整个终故又称VH区底下邻接的核仁内层状内部结构互作，并且与激素长时间前体肝细胞内的互作总体值得注意，暗示CTCF裂解后IgH核苷酸的核仁内层做成完全恢复抑制作用到终故又称VH区底下邻接。那么除此大多的，终故又称VH是否也完全恢复了上方体能够呢？
答案是无疑的！学术深入研究实质性检测了V(D)J上方体变化，找到CTCF裂解十分祚着地、甚至有时前所未有有地触发了绝极少VH，大多终故又称VH的上方体能够，并且与激素长时间前体B肝细胞相比，虽然并不100%相反，CTCF裂解后的v-Abl肝细胞系仍然乏善可陈出主体上十分值得注意的VH上方体阈值和模式。除此大多的，CTCF裂解后的v-Abl肝细胞系在VHDJH和DJH上方体的相对比率上祚着增高并十分相比之下长时间激素前体B肝细胞中的的数值，暗示VH上方体在主体素质上也确实前所未有有提高了。另除此以外，学术深入研究还通过数据分析RAG触发的off-target大块活性找到只有在CTCF裂解后的肝细胞中的RAG才高频大块了整个VH区底下邻接带有特定一段距离的off-target核苷酸，实质性支持了CTCF一声除使得RAG追踪能够抑制作用于整个VH区底下邻接从而触发终故又称VH上方体的结论。
此除此以外，学术深入研究还实质性学术研究了CTCF-degron框架创建更为实质性中的产生的其它上方态的肝细胞系中的终故又称VH上方体与CTCF酶素质以及潜在活性错综复杂的关系：找到CTCF C故又称断开触发裂解的AID-GFP线圈祚着降低了CTCF酶素质，除此大多的终故又称VH开始引发上方体；未有经auxin处理的CTCF-degron框架发挥作用leaky CTCF裂解，使得CTCF酶素质实质性降低，除此大多的终故又称VH上方体程度更为高；实质性的auxin处理依然裂解了主体CTCF酶素质，除此大多的终故又称VH上方体更为加剧烈。这些结果暗示终故又称VH上方体对于CTCF酶素质以及潜在的活性的变化敏感，即后者的持续上升对于触发RAG追踪终故又称VH触发其上方体带有关键性的正向抑制作用。最后，实质性通过综合各种组学数据进行更为细致的数据分析，学术深入研究看来在CTCF活性持续上升更为实质性中的VH的上方体显然受到湿气CTCF混合核苷酸以及VH磷酸化素质的因素，从而洞察了在进化上激素完全相同VH邻接显然回避了完全相同的意图应有各VH的上方体创造性。
基于上述试验中找到和数据分析，学术深入研究最后提出异议了cohesin和CTCF策划的核仁内层做成触发的RAG追踪进行VH性状上方体的建模，并看来在激素B肝细胞最初受精更为实质性中的发挥作用这样一来转录CTCF/CBE阻截若无活性、或者通过转录cohesin等其它内层做成q活性从而间接减轻CTCF/CBE的阻截波动从而允许cohesin触发的内层做成更为实质性马达RAG追踪整个VH区底下邻接而付诸VH的上方体。
总体而言，该学术研究平庸论据并设计和回避了机智的试验中意图不仅确证了cohesin触发的内层做成更为实质性在RAG追踪更为实质性中的的关键性马达抑制作用，并且第一次洞察对单个CTCF酶素质的转录可以触发中距离VH上方体更为实质性。据我们了解了解到，该社才会活动在评委才会更为实质性中的受到多位审稿人的总体评价，审稿人不仅无疑了其在免疫球酶可视区底下多样化控制系统疑虑上透过了“clear and sharp answer”，还无疑了其找到对于更为普遍的性状组核仁内部结构及性状磷酸化的调节同样带有关键性的本质。审稿人这样一来写道：“These findings establish a new paradigm for the V-to-DJ recombination step of antigen receptor gene assembly. The findings also lead to a pleasing mechanistic simplification and unification， in that now， all recombination events taking place outside of the RC at Igh (and perhaps other loci) can be envisioned to be operating by a single fundamental scanning mechanism. This is destined to be a landmark study for the field.”
相比较的是，比这篇短文不久前投稿并发送到最近在Nature在线发表的另一篇学术研究短文洞察激素前体B肝细胞中的cohesin核仁混合活性的负转录qWapl的磷酸化素质与IgH核苷酸中距离核仁相互抑制作用以及VH上方体其所，并实质性找到Wapl磷酸化素质持续上升的前体B肝细胞中的cohesin在核仁上的停留时间增高（参阅BioArt报道：Nature | 粘连酶释放qWapl加强V性状上方体的控制系统）。先前在多种其它肝细胞中的已断定Wapl素质持续上升能够主体上通过延长cohesin核仁停留时间从而减轻才会聚排列CBE线圈对内层做成更为实质性的阻截波动从而延长核仁内层状内部结构邻接。基于此，该短文看来激素前体B肝细胞通过在磷酸化素质上下调Wapl从而加强IgH核苷酸内层做成触发的VH性状上方体。阐述一起，这两篇短文从完全相同角度利用完全相同意图最终洞察了一个内在独立的免疫球酶重链V性状上方体的关键性控制系统。
早期出处：
Zhaoqing Ba, Jiangman Lou, Adam Yongxin Ye,et al.CTCF orchestrates long-range cohesin-driven V(D)J recombinational scanning.Nature.Published: 27 July 2020
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